Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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Rnf138rt1Q9D9M9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rnf138rt1Q9D9M9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rnf138rt1Q9D9M9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rnf138rt1Q9D9M9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rnf138rt1Q9D9M9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf138rt1Q9D9M9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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Rnf138rt1Q9D9M9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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Rnf138rt1Q9D9M9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf138rt1Q9D9M9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf138rt1Q9D9M9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf138rt1Q9D9M9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf138rt1Q9D9M9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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Rnf138rt1Q9D9M9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnf138rt1Q9D9M9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
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Rnf138rt1Q9D9M9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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