Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms