Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H8

UPF0565 protein C2orf69 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9H8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Q9D9H8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Q9D9H8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Q9D9H8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Q9D9H8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Q9D9H8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Q9D9H8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Q9D9H8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Q9D9H8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Q9D9H8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Q9D9H8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Q9D9H8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Q9D9H8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Q9D9H8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Q9D9H8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Q9D9H8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Q9D9H8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Q9D9H8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Q9D9H8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Q9D9H8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Q9D9H8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Q9D9H8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Q9D9H8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Q9D9H8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Q9D9H8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Q9D9H8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Q9D9H8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Q9D9H8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Q9D9H8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Q9D9H8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Q9D9H8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Q9D9H8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Q9D9H8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Q9D9H8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Q9D9H8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Q9D9H8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Q9D9H8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Q9D9H8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Q9D9H8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Q9D9H8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Q9D9H8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Q9D9H8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Q9D9H8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Q9D9H8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Q9D9H8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Q9D9H8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Q9D9H8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Q9D9H8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Q9D9H8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Q9D9H8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Q9D9H8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Q9D9H8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Q9D9H8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Q9D9H8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Q9D9H8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Q9D9H8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Q9D9H8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Q9D9H8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Q9D9H8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Q9D9H8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Q9D9H8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Q9D9H8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Q9D9H8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Q9D9H8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Q9D9H8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Q9D9H8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Q9D9H8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Q9D9H8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Q9D9H8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Q9D9H8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Q9D9H8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Q9D9H8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Q9D9H8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Q9D9H8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Q9D9H8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Q9D9H8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Q9D9H8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Q9D9H8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Q9D9H8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Q9D9H8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Q9D9H8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Q9D9H8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Q9D9H8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Q9D9H8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Q9D9H8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Q9D9H8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Q9D9H8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Q9D9H8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Q9D9H8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Q9D9H8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Q9D9H8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Q9D9H8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Q9D9H8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Q9D9H8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Q9D9H8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Q9D9H8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Q9D9H8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Q9D9H8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Q9D9H8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Q9D9H8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms