Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmco5aQ9D9D5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmco5aQ9D9D5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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