Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SlirpQ9D8T7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SlirpQ9D8T7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms