Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn22Q9D7U6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn22Q9D7U6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn22Q9D7U6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn22Q9D7U6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn22Q9D7U6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn22Q9D7U6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn22Q9D7U6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn22Q9D7U6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn22Q9D7U6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cldn22Q9D7U6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cldn22Q9D7U6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cldn22Q9D7U6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cldn22Q9D7U6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cldn22Q9D7U6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cldn22Q9D7U6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cldn22Q9D7U6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cldn22Q9D7U6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cldn22Q9D7U6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cldn22Q9D7U6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cldn22Q9D7U6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cldn22Q9D7U6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cldn22Q9D7U6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cldn22Q9D7U6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cldn22Q9D7U6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Cldn22Q9D7U6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cldn22Q9D7U6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cldn22Q9D7U6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cldn22Q9D7U6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn22Q9D7U6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn22Q9D7U6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn22Q9D7U6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn22Q9D7U6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn22Q9D7U6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn22Q9D7U6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn22Q9D7U6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn22Q9D7U6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn22Q9D7U6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn22Q9D7U6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn22Q9D7U6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn22Q9D7U6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn22Q9D7U6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn22Q9D7U6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn22Q9D7U6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn22Q9D7U6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn22Q9D7U6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn22Q9D7U6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn22Q9D7U6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn22Q9D7U6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn22Q9D7U6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn22Q9D7U6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn22Q9D7U6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn22Q9D7U6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn22Q9D7U6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn22Q9D7U6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cldn22Q9D7U6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cldn22Q9D7U6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cldn22Q9D7U6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cldn22Q9D7U6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cldn22Q9D7U6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cldn22Q9D7U6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cldn22Q9D7U6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cldn22Q9D7U6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cldn22Q9D7U6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cldn22Q9D7U6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cldn22Q9D7U6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cldn22Q9D7U6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cldn22Q9D7U6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cldn22Q9D7U6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn22Q9D7U6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn22Q9D7U6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn22Q9D7U6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn22Q9D7U6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn22Q9D7U6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn22Q9D7U6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn22Q9D7U6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn22Q9D7U6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn22Q9D7U6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn22Q9D7U6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn22Q9D7U6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn22Q9D7U6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn22Q9D7U6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn22Q9D7U6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn22Q9D7U6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn22Q9D7U6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn22Q9D7U6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn22Q9D7U6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn22Q9D7U6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn22Q9D7U6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn22Q9D7U6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn22Q9D7U6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn22Q9D7U6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn22Q9D7U6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn22Q9D7U6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn22Q9D7U6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn22Q9D7U6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn22Q9D7U6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn22Q9D7U6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn22Q9D7U6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn22Q9D7U6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
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