Protein–RNA interactions for Protein: Q9D706

Rpap3, RNA polymerase II-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap3Q9D706 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpap3Q9D706 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpap3Q9D706 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpap3Q9D706 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpap3Q9D706 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpap3Q9D706 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpap3Q9D706 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpap3Q9D706 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpap3Q9D706 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpap3Q9D706 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpap3Q9D706 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpap3Q9D706 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpap3Q9D706 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpap3Q9D706 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpap3Q9D706 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpap3Q9D706 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpap3Q9D706 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpap3Q9D706 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpap3Q9D706 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpap3Q9D706 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpap3Q9D706 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpap3Q9D706 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpap3Q9D706 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpap3Q9D706 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpap3Q9D706 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpap3Q9D706 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpap3Q9D706 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpap3Q9D706 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpap3Q9D706 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpap3Q9D706 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpap3Q9D706 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpap3Q9D706 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpap3Q9D706 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpap3Q9D706 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpap3Q9D706 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpap3Q9D706 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpap3Q9D706 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpap3Q9D706 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpap3Q9D706 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpap3Q9D706 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpap3Q9D706 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpap3Q9D706 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpap3Q9D706 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpap3Q9D706 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpap3Q9D706 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpap3Q9D706 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpap3Q9D706 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpap3Q9D706 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpap3Q9D706 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpap3Q9D706 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rpap3Q9D706 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rpap3Q9D706 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rpap3Q9D706 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rpap3Q9D706 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rpap3Q9D706 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpap3Q9D706 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpap3Q9D706 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpap3Q9D706 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpap3Q9D706 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpap3Q9D706 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpap3Q9D706 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpap3Q9D706 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpap3Q9D706 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpap3Q9D706 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpap3Q9D706 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpap3Q9D706 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpap3Q9D706 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpap3Q9D706 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpap3Q9D706 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpap3Q9D706 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpap3Q9D706 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpap3Q9D706 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpap3Q9D706 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpap3Q9D706 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpap3Q9D706 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpap3Q9D706 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpap3Q9D706 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpap3Q9D706 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpap3Q9D706 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpap3Q9D706 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpap3Q9D706 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpap3Q9D706 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpap3Q9D706 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpap3Q9D706 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpap3Q9D706 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpap3Q9D706 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpap3Q9D706 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpap3Q9D706 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpap3Q9D706 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpap3Q9D706 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpap3Q9D706 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpap3Q9D706 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpap3Q9D706 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpap3Q9D706 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpap3Q9D706 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpap3Q9D706 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpap3Q9D706 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpap3Q9D706 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpap3Q9D706 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpap3Q9D706 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms