Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
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Nop56Q9D6Z1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nop56Q9D6Z1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nop56Q9D6Z1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nop56Q9D6Z1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nop56Q9D6Z1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nop56Q9D6Z1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nop56Q9D6Z1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nop56Q9D6Z1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nop56Q9D6Z1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nop56Q9D6Z1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nop56Q9D6Z1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nop56Q9D6Z1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nop56Q9D6Z1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nop56Q9D6Z1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nop56Q9D6Z1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nop56Q9D6Z1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nop56Q9D6Z1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nop56Q9D6Z1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nop56Q9D6Z1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nop56Q9D6Z1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nop56Q9D6Z1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nop56Q9D6Z1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nop56Q9D6Z1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nop56Q9D6Z1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nop56Q9D6Z1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nop56Q9D6Z1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nop56Q9D6Z1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nop56Q9D6Z1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nop56Q9D6Z1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Nop56Q9D6Z1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Nop56Q9D6Z1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nop56Q9D6Z1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nop56Q9D6Z1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nop56Q9D6Z1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Nop56Q9D6Z1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nop56Q9D6Z1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nop56Q9D6Z1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Nop56Q9D6Z1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Nop56Q9D6Z1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Nop56Q9D6Z1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nop56Q9D6Z1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nop56Q9D6Z1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nop56Q9D6Z1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nop56Q9D6Z1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Nop56Q9D6Z1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Nop56Q9D6Z1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nop56Q9D6Z1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nop56Q9D6Z1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Nop56Q9D6Z1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Nop56Q9D6Z1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nop56Q9D6Z1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nop56Q9D6Z1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nop56Q9D6Z1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nop56Q9D6Z1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nop56Q9D6Z1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nop56Q9D6Z1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nop56Q9D6Z1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nop56Q9D6Z1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nop56Q9D6Z1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nop56Q9D6Z1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Nop56Q9D6Z1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nop56Q9D6Z1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nop56Q9D6Z1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nop56Q9D6Z1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nop56Q9D6Z1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nop56Q9D6Z1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nop56Q9D6Z1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nop56Q9D6Z1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nop56Q9D6Z1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nop56Q9D6Z1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nop56Q9D6Z1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nop56Q9D6Z1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nop56Q9D6Z1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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