Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gbe1Q9D6Y9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gbe1Q9D6Y9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gbe1Q9D6Y9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gbe1Q9D6Y9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gbe1Q9D6Y9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gbe1Q9D6Y9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gbe1Q9D6Y9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gbe1Q9D6Y9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gbe1Q9D6Y9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gbe1Q9D6Y9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gbe1Q9D6Y9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gbe1Q9D6Y9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gbe1Q9D6Y9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gbe1Q9D6Y9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Gbe1Q9D6Y9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gbe1Q9D6Y9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gbe1Q9D6Y9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gbe1Q9D6Y9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gbe1Q9D6Y9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gbe1Q9D6Y9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gbe1Q9D6Y9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms