Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc94Q9D6J3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc94Q9D6J3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc94Q9D6J3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc94Q9D6J3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc94Q9D6J3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc94Q9D6J3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc94Q9D6J3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc94Q9D6J3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc94Q9D6J3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc94Q9D6J3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc94Q9D6J3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc94Q9D6J3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc94Q9D6J3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc94Q9D6J3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc94Q9D6J3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc94Q9D6J3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc94Q9D6J3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc94Q9D6J3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc94Q9D6J3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc94Q9D6J3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc94Q9D6J3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc94Q9D6J3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc94Q9D6J3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc94Q9D6J3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc94Q9D6J3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc94Q9D6J3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc94Q9D6J3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc94Q9D6J3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc94Q9D6J3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc94Q9D6J3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc94Q9D6J3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc94Q9D6J3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc94Q9D6J3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc94Q9D6J3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc94Q9D6J3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc94Q9D6J3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc94Q9D6J3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc94Q9D6J3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc94Q9D6J3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc94Q9D6J3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc94Q9D6J3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc94Q9D6J3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc94Q9D6J3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc94Q9D6J3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc94Q9D6J3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc94Q9D6J3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc94Q9D6J3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc94Q9D6J3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc94Q9D6J3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc94Q9D6J3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc94Q9D6J3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc94Q9D6J3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc94Q9D6J3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc94Q9D6J3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc94Q9D6J3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms