Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G3

2900055J20Rik, RIKEN cDNA 2900055J20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2900055J20RikQ9D6G3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
2900055J20RikQ9D6G3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms