Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms