Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc81Q9D5W4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms