Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5T0

Atad1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad1Q9D5T0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atad1Q9D5T0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atad1Q9D5T0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Atad1Q9D5T0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atad1Q9D5T0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atad1Q9D5T0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atad1Q9D5T0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atad1Q9D5T0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atad1Q9D5T0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atad1Q9D5T0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atad1Q9D5T0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atad1Q9D5T0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atad1Q9D5T0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atad1Q9D5T0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atad1Q9D5T0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atad1Q9D5T0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Atad1Q9D5T0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atad1Q9D5T0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atad1Q9D5T0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atad1Q9D5T0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atad1Q9D5T0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atad1Q9D5T0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atad1Q9D5T0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atad1Q9D5T0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atad1Q9D5T0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atad1Q9D5T0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atad1Q9D5T0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atad1Q9D5T0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atad1Q9D5T0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atad1Q9D5T0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atad1Q9D5T0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Atad1Q9D5T0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atad1Q9D5T0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atad1Q9D5T0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms