Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Speer4f1Q9D5Q6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Speer4f1Q9D5Q6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Speer4f1Q9D5Q6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Speer4f1Q9D5Q6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Speer4f1Q9D5Q6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Speer4f1Q9D5Q6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Speer4f1Q9D5Q6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Speer4f1Q9D5Q6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Speer4f1Q9D5Q6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Speer4f1Q9D5Q6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Speer4f1Q9D5Q6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Speer4f1Q9D5Q6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Speer4f1Q9D5Q6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Speer4f1Q9D5Q6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Speer4f1Q9D5Q6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Speer4f1Q9D5Q6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Speer4f1Q9D5Q6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Speer4f1Q9D5Q6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Speer4f1Q9D5Q6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Speer4f1Q9D5Q6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Speer4f1Q9D5Q6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Speer4f1Q9D5Q6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Speer4f1Q9D5Q6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Speer4f1Q9D5Q6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Speer4f1Q9D5Q6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Speer4f1Q9D5Q6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Speer4f1Q9D5Q6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Speer4f1Q9D5Q6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Speer4f1Q9D5Q6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Speer4f1Q9D5Q6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Speer4f1Q9D5Q6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Speer4f1Q9D5Q6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Speer4f1Q9D5Q6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Speer4f1Q9D5Q6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Speer4f1Q9D5Q6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Speer4f1Q9D5Q6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Speer4f1Q9D5Q6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Speer4f1Q9D5Q6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Speer4f1Q9D5Q6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Speer4f1Q9D5Q6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Speer4f1Q9D5Q6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Speer4f1Q9D5Q6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Speer4f1Q9D5Q6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Speer4f1Q9D5Q6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Speer4f1Q9D5Q6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Speer4f1Q9D5Q6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Speer4f1Q9D5Q6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Speer4f1Q9D5Q6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Speer4f1Q9D5Q6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Speer4f1Q9D5Q6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Speer4f1Q9D5Q6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Speer4f1Q9D5Q6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Speer4f1Q9D5Q6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Speer4f1Q9D5Q6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Speer4f1Q9D5Q6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Speer4f1Q9D5Q6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Speer4f1Q9D5Q6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Speer4f1Q9D5Q6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Speer4f1Q9D5Q6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Speer4f1Q9D5Q6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Speer4f1Q9D5Q6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Speer4f1Q9D5Q6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Speer4f1Q9D5Q6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Speer4f1Q9D5Q6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Speer4f1Q9D5Q6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Speer4f1Q9D5Q6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Speer4f1Q9D5Q6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Speer4f1Q9D5Q6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Speer4f1Q9D5Q6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Speer4f1Q9D5Q6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Speer4f1Q9D5Q6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Speer4f1Q9D5Q6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Speer4f1Q9D5Q6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Speer4f1Q9D5Q6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Speer4f1Q9D5Q6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Speer4f1Q9D5Q6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Speer4f1Q9D5Q6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Speer4f1Q9D5Q6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Speer4f1Q9D5Q6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Speer4f1Q9D5Q6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Speer4f1Q9D5Q6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Speer4f1Q9D5Q6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Speer4f1Q9D5Q6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Speer4f1Q9D5Q6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Speer4f1Q9D5Q6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Speer4f1Q9D5Q6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Speer4f1Q9D5Q6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Speer4f1Q9D5Q6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Speer4f1Q9D5Q6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Speer4f1Q9D5Q6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Speer4f1Q9D5Q6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Speer4f1Q9D5Q6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Speer4f1Q9D5Q6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Speer4f1Q9D5Q6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Speer4f1Q9D5Q6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms