Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ubxn11Q9D572 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubxn11Q9D572 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubxn11Q9D572 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubxn11Q9D572 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubxn11Q9D572 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubxn11Q9D572 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ubxn11Q9D572 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ubxn11Q9D572 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ubxn11Q9D572 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ubxn11Q9D572 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ubxn11Q9D572 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ubxn11Q9D572 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ubxn11Q9D572 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubxn11Q9D572 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubxn11Q9D572 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubxn11Q9D572 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubxn11Q9D572 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubxn11Q9D572 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubxn11Q9D572 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubxn11Q9D572 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubxn11Q9D572 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubxn11Q9D572 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubxn11Q9D572 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubxn11Q9D572 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubxn11Q9D572 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubxn11Q9D572 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubxn11Q9D572 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubxn11Q9D572 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubxn11Q9D572 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubxn11Q9D572 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubxn11Q9D572 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubxn11Q9D572 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubxn11Q9D572 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubxn11Q9D572 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubxn11Q9D572 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubxn11Q9D572 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubxn11Q9D572 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubxn11Q9D572 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubxn11Q9D572 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubxn11Q9D572 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubxn11Q9D572 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubxn11Q9D572 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubxn11Q9D572 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubxn11Q9D572 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubxn11Q9D572 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubxn11Q9D572 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubxn11Q9D572 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubxn11Q9D572 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubxn11Q9D572 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubxn11Q9D572 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubxn11Q9D572 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubxn11Q9D572 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubxn11Q9D572 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubxn11Q9D572 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubxn11Q9D572 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubxn11Q9D572 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubxn11Q9D572 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms