Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms