Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Clvs1Q9D4C9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms