Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9D454 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9D454 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9D454 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9D454 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9D454 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9D454 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9D454 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9D454 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9D454 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9D454 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9D454 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9D454 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9D454 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9D454 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9D454 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9D454 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9D454 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9D454 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9D454 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9D454 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9D454 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9D454 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9D454 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9D454 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9D454 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9D454 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9D454 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9D454 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9D454 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D454 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D454 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D454 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D454 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D454 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D454 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D454 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D454 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D454 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D454 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D454 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D454 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D454 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D454 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D454 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D454 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D454 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D454 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D454 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D454 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D454 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D454 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D454 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D454 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D454 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D454 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D454 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D454 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D454 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D454 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D454 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D454 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D454 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D454 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D454 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D454 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D454 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D454 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D454 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D454 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D454 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D454 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D454 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D454 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D454 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D454 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D454 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D454 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D454 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D454 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D454 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D454 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D454 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D454 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D454 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D454 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D454 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D454 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D454 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D454 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D454 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D454 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D454 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D454 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D454 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D454 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D454 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D454 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D454 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D454 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms