Protein–RNA interactions for Protein: Q9D413

Sh2d6, SH2 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d6Q9D413 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d6Q9D413 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d6Q9D413 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d6Q9D413 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d6Q9D413 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d6Q9D413 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d6Q9D413 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d6Q9D413 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d6Q9D413 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d6Q9D413 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d6Q9D413 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d6Q9D413 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d6Q9D413 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d6Q9D413 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d6Q9D413 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d6Q9D413 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d6Q9D413 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d6Q9D413 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d6Q9D413 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh2d6Q9D413 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh2d6Q9D413 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh2d6Q9D413 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh2d6Q9D413 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh2d6Q9D413 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh2d6Q9D413 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh2d6Q9D413 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh2d6Q9D413 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh2d6Q9D413 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh2d6Q9D413 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms