Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpn3Q9D3W4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpn3Q9D3W4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpn3Q9D3W4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpn3Q9D3W4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpn3Q9D3W4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpn3Q9D3W4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpn3Q9D3W4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpn3Q9D3W4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpn3Q9D3W4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpn3Q9D3W4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpn3Q9D3W4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpn3Q9D3W4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpn3Q9D3W4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpn3Q9D3W4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpn3Q9D3W4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpn3Q9D3W4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpn3Q9D3W4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpn3Q9D3W4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpn3Q9D3W4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpn3Q9D3W4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpn3Q9D3W4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpn3Q9D3W4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpn3Q9D3W4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpn3Q9D3W4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpn3Q9D3W4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpn3Q9D3W4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gpn3Q9D3W4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms