Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx29Q9D3S3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms