Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3D0

Ttpal, Alpha-tocopherol transfer protein-like, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpalQ9D3D0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TtpalQ9D3D0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TtpalQ9D3D0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TtpalQ9D3D0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TtpalQ9D3D0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TtpalQ9D3D0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TtpalQ9D3D0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TtpalQ9D3D0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TtpalQ9D3D0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TtpalQ9D3D0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TtpalQ9D3D0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TtpalQ9D3D0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TtpalQ9D3D0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TtpalQ9D3D0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TtpalQ9D3D0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TtpalQ9D3D0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TtpalQ9D3D0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TtpalQ9D3D0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TtpalQ9D3D0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TtpalQ9D3D0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TtpalQ9D3D0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TtpalQ9D3D0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TtpalQ9D3D0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TtpalQ9D3D0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TtpalQ9D3D0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TtpalQ9D3D0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TtpalQ9D3D0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TtpalQ9D3D0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TtpalQ9D3D0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TtpalQ9D3D0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TtpalQ9D3D0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TtpalQ9D3D0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TtpalQ9D3D0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TtpalQ9D3D0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TtpalQ9D3D0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TtpalQ9D3D0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms