Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rufy3Q9D394 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rufy3Q9D394 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rufy3Q9D394 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rufy3Q9D394 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rufy3Q9D394 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rufy3Q9D394 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rufy3Q9D394 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rufy3Q9D394 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rufy3Q9D394 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rufy3Q9D394 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rufy3Q9D394 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rufy3Q9D394 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rufy3Q9D394 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rufy3Q9D394 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rufy3Q9D394 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rufy3Q9D394 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rufy3Q9D394 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rufy3Q9D394 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rufy3Q9D394 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rufy3Q9D394 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rufy3Q9D394 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rufy3Q9D394 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rufy3Q9D394 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rufy3Q9D394 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rufy3Q9D394 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rufy3Q9D394 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rufy3Q9D394 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rufy3Q9D394 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rufy3Q9D394 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rufy3Q9D394 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rufy3Q9D394 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rufy3Q9D394 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rufy3Q9D394 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rufy3Q9D394 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rufy3Q9D394 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rufy3Q9D394 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rufy3Q9D394 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rufy3Q9D394 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rufy3Q9D394 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rufy3Q9D394 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rufy3Q9D394 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rufy3Q9D394 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rufy3Q9D394 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rufy3Q9D394 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rufy3Q9D394 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rufy3Q9D394 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rufy3Q9D394 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms