Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2J4

Vsig1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig1Q9D2J4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vsig1Q9D2J4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vsig1Q9D2J4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vsig1Q9D2J4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vsig1Q9D2J4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vsig1Q9D2J4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vsig1Q9D2J4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vsig1Q9D2J4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vsig1Q9D2J4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vsig1Q9D2J4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vsig1Q9D2J4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vsig1Q9D2J4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vsig1Q9D2J4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vsig1Q9D2J4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vsig1Q9D2J4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vsig1Q9D2J4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vsig1Q9D2J4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vsig1Q9D2J4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vsig1Q9D2J4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vsig1Q9D2J4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vsig1Q9D2J4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vsig1Q9D2J4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vsig1Q9D2J4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vsig1Q9D2J4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vsig1Q9D2J4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vsig1Q9D2J4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vsig1Q9D2J4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vsig1Q9D2J4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vsig1Q9D2J4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vsig1Q9D2J4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vsig1Q9D2J4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vsig1Q9D2J4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vsig1Q9D2J4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vsig1Q9D2J4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Vsig1Q9D2J4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vsig1Q9D2J4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vsig1Q9D2J4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vsig1Q9D2J4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vsig1Q9D2J4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vsig1Q9D2J4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vsig1Q9D2J4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vsig1Q9D2J4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vsig1Q9D2J4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vsig1Q9D2J4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vsig1Q9D2J4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Vsig1Q9D2J4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vsig1Q9D2J4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vsig1Q9D2J4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vsig1Q9D2J4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vsig1Q9D2J4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vsig1Q9D2J4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vsig1Q9D2J4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vsig1Q9D2J4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Vsig1Q9D2J4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vsig1Q9D2J4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vsig1Q9D2J4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vsig1Q9D2J4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vsig1Q9D2J4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vsig1Q9D2J4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vsig1Q9D2J4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vsig1Q9D2J4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vsig1Q9D2J4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vsig1Q9D2J4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vsig1Q9D2J4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vsig1Q9D2J4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vsig1Q9D2J4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vsig1Q9D2J4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vsig1Q9D2J4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vsig1Q9D2J4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vsig1Q9D2J4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vsig1Q9D2J4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vsig1Q9D2J4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vsig1Q9D2J4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vsig1Q9D2J4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vsig1Q9D2J4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vsig1Q9D2J4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vsig1Q9D2J4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vsig1Q9D2J4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vsig1Q9D2J4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vsig1Q9D2J4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vsig1Q9D2J4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vsig1Q9D2J4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vsig1Q9D2J4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vsig1Q9D2J4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vsig1Q9D2J4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vsig1Q9D2J4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vsig1Q9D2J4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vsig1Q9D2J4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vsig1Q9D2J4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vsig1Q9D2J4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vsig1Q9D2J4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vsig1Q9D2J4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vsig1Q9D2J4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vsig1Q9D2J4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vsig1Q9D2J4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vsig1Q9D2J4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vsig1Q9D2J4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vsig1Q9D2J4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vsig1Q9D2J4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vsig1Q9D2J4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms