Protein–RNA interactions for Protein: Q9D260

9230112D13Rik, RIKEN cDNA 9230112D13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9230112D13RikQ9D260 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
9230112D13RikQ9D260 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
9230112D13RikQ9D260 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
9230112D13RikQ9D260 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
9230112D13RikQ9D260 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
9230112D13RikQ9D260 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
9230112D13RikQ9D260 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
9230112D13RikQ9D260 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
9230112D13RikQ9D260 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
9230112D13RikQ9D260 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
9230112D13RikQ9D260 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
9230112D13RikQ9D260 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
9230112D13RikQ9D260 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
9230112D13RikQ9D260 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
9230112D13RikQ9D260 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
9230112D13RikQ9D260 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
9230112D13RikQ9D260 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
9230112D13RikQ9D260 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
9230112D13RikQ9D260 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
9230112D13RikQ9D260 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
9230112D13RikQ9D260 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
9230112D13RikQ9D260 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
9230112D13RikQ9D260 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
9230112D13RikQ9D260 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
9230112D13RikQ9D260 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
9230112D13RikQ9D260 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
9230112D13RikQ9D260 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
9230112D13RikQ9D260 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
9230112D13RikQ9D260 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
9230112D13RikQ9D260 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
9230112D13RikQ9D260 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
9230112D13RikQ9D260 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
9230112D13RikQ9D260 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
9230112D13RikQ9D260 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
9230112D13RikQ9D260 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
9230112D13RikQ9D260 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
9230112D13RikQ9D260 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
9230112D13RikQ9D260 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
9230112D13RikQ9D260 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
9230112D13RikQ9D260 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
9230112D13RikQ9D260 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
9230112D13RikQ9D260 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
9230112D13RikQ9D260 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
9230112D13RikQ9D260 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
9230112D13RikQ9D260 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
9230112D13RikQ9D260 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
9230112D13RikQ9D260 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms