Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Y9

Shisal2b, Protein shisa-like-2B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2bQ9D1Y9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisal2bQ9D1Y9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms