Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl53Q9D1H8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms