Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lmbr1lQ9D1E5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lmbr1lQ9D1E5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lmbr1lQ9D1E5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lmbr1lQ9D1E5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lmbr1lQ9D1E5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lmbr1lQ9D1E5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lmbr1lQ9D1E5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmbr1lQ9D1E5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmbr1lQ9D1E5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmbr1lQ9D1E5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmbr1lQ9D1E5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmbr1lQ9D1E5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmbr1lQ9D1E5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmbr1lQ9D1E5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmbr1lQ9D1E5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmbr1lQ9D1E5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmbr1lQ9D1E5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmbr1lQ9D1E5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmbr1lQ9D1E5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmbr1lQ9D1E5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmbr1lQ9D1E5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmbr1lQ9D1E5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmbr1lQ9D1E5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmbr1lQ9D1E5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lmbr1lQ9D1E5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lmbr1lQ9D1E5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lmbr1lQ9D1E5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lmbr1lQ9D1E5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms