Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M2

Cdca7, Cell division cycle-associated protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca7Q9D0M2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdca7Q9D0M2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdca7Q9D0M2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdca7Q9D0M2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdca7Q9D0M2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdca7Q9D0M2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdca7Q9D0M2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdca7Q9D0M2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdca7Q9D0M2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdca7Q9D0M2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdca7Q9D0M2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdca7Q9D0M2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdca7Q9D0M2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdca7Q9D0M2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdca7Q9D0M2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdca7Q9D0M2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdca7Q9D0M2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdca7Q9D0M2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdca7Q9D0M2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdca7Q9D0M2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdca7Q9D0M2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdca7Q9D0M2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdca7Q9D0M2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Cdca7Q9D0M2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdca7Q9D0M2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdca7Q9D0M2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdca7Q9D0M2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdca7Q9D0M2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdca7Q9D0M2 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdca7Q9D0M2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdca7Q9D0M2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdca7Q9D0M2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdca7Q9D0M2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdca7Q9D0M2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdca7Q9D0M2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdca7Q9D0M2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdca7Q9D0M2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdca7Q9D0M2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdca7Q9D0M2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdca7Q9D0M2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdca7Q9D0M2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdca7Q9D0M2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdca7Q9D0M2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdca7Q9D0M2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdca7Q9D0M2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdca7Q9D0M2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdca7Q9D0M2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdca7Q9D0M2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdca7Q9D0M2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdca7Q9D0M2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdca7Q9D0M2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdca7Q9D0M2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdca7Q9D0M2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdca7Q9D0M2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdca7Q9D0M2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdca7Q9D0M2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdca7Q9D0M2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdca7Q9D0M2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdca7Q9D0M2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdca7Q9D0M2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdca7Q9D0M2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdca7Q9D0M2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdca7Q9D0M2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdca7Q9D0M2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdca7Q9D0M2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdca7Q9D0M2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdca7Q9D0M2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdca7Q9D0M2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdca7Q9D0M2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdca7Q9D0M2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdca7Q9D0M2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdca7Q9D0M2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdca7Q9D0M2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdca7Q9D0M2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdca7Q9D0M2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdca7Q9D0M2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdca7Q9D0M2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdca7Q9D0M2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdca7Q9D0M2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdca7Q9D0M2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdca7Q9D0M2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdca7Q9D0M2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdca7Q9D0M2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdca7Q9D0M2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdca7Q9D0M2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdca7Q9D0M2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdca7Q9D0M2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdca7Q9D0M2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdca7Q9D0M2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdca7Q9D0M2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdca7Q9D0M2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdca7Q9D0M2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdca7Q9D0M2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdca7Q9D0M2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdca7Q9D0M2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdca7Q9D0M2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdca7Q9D0M2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdca7Q9D0M2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdca7Q9D0M2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdca7Q9D0M2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms