Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT6

Cmss1, Protein CMSS1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmss1Q9CZT6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cmss1Q9CZT6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmss1Q9CZT6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms