Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisa9Q9CZN4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms