Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Utp11Q9CZJ1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms