Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ91

Srfbp1, Serum response factor-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srfbp1Q9CZ91 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Srfbp1Q9CZ91 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Srfbp1Q9CZ91 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srfbp1Q9CZ91 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srfbp1Q9CZ91 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srfbp1Q9CZ91 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srfbp1Q9CZ91 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srfbp1Q9CZ91 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srfbp1Q9CZ91 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srfbp1Q9CZ91 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srfbp1Q9CZ91 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srfbp1Q9CZ91 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srfbp1Q9CZ91 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srfbp1Q9CZ91 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srfbp1Q9CZ91 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srfbp1Q9CZ91 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Srfbp1Q9CZ91 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srfbp1Q9CZ91 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srfbp1Q9CZ91 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srfbp1Q9CZ91 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms