Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms