Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Exo5Q9CXP9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Exo5Q9CXP9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Exo5Q9CXP9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Exo5Q9CXP9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Exo5Q9CXP9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Exo5Q9CXP9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Exo5Q9CXP9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Exo5Q9CXP9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Exo5Q9CXP9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Exo5Q9CXP9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Exo5Q9CXP9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Exo5Q9CXP9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Exo5Q9CXP9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Exo5Q9CXP9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Exo5Q9CXP9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Exo5Q9CXP9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Exo5Q9CXP9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Exo5Q9CXP9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Exo5Q9CXP9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms