Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXL1

Tmem50a, Transmembrane protein 50A, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem50aQ9CXL1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem50aQ9CXL1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem50aQ9CXL1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem50aQ9CXL1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem50aQ9CXL1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem50aQ9CXL1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem50aQ9CXL1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem50aQ9CXL1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem50aQ9CXL1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem50aQ9CXL1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem50aQ9CXL1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem50aQ9CXL1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem50aQ9CXL1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem50aQ9CXL1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem50aQ9CXL1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem50aQ9CXL1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem50aQ9CXL1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem50aQ9CXL1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem50aQ9CXL1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem50aQ9CXL1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem50aQ9CXL1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem50aQ9CXL1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem50aQ9CXL1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem50aQ9CXL1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem50aQ9CXL1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem50aQ9CXL1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem50aQ9CXL1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem50aQ9CXL1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem50aQ9CXL1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem50aQ9CXL1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem50aQ9CXL1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms