Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms