Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tmed5Q9CXE7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms