Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prdm5Q9CXE0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms