Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXC3

Mgme1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgme1Q9CXC3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mgme1Q9CXC3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms