Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXB8

Alpk1, Alpha-protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alpk1Q9CXB8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Alpk1Q9CXB8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Alpk1Q9CXB8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Alpk1Q9CXB8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Alpk1Q9CXB8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Alpk1Q9CXB8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Alpk1Q9CXB8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Alpk1Q9CXB8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Alpk1Q9CXB8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Alpk1Q9CXB8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Alpk1Q9CXB8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Alpk1Q9CXB8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Alpk1Q9CXB8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Alpk1Q9CXB8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Alpk1Q9CXB8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Alpk1Q9CXB8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Alpk1Q9CXB8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Alpk1Q9CXB8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Alpk1Q9CXB8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Alpk1Q9CXB8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Alpk1Q9CXB8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Alpk1Q9CXB8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Alpk1Q9CXB8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Alpk1Q9CXB8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Alpk1Q9CXB8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Alpk1Q9CXB8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Alpk1Q9CXB8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Alpk1Q9CXB8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Alpk1Q9CXB8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Alpk1Q9CXB8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Alpk1Q9CXB8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Alpk1Q9CXB8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Alpk1Q9CXB8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Alpk1Q9CXB8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Alpk1Q9CXB8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Alpk1Q9CXB8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Alpk1Q9CXB8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Alpk1Q9CXB8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Alpk1Q9CXB8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Alpk1Q9CXB8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Alpk1Q9CXB8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Alpk1Q9CXB8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Alpk1Q9CXB8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Alpk1Q9CXB8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Alpk1Q9CXB8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Alpk1Q9CXB8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Alpk1Q9CXB8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Alpk1Q9CXB8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Alpk1Q9CXB8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Alpk1Q9CXB8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Alpk1Q9CXB8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Alpk1Q9CXB8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Alpk1Q9CXB8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Alpk1Q9CXB8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Alpk1Q9CXB8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Alpk1Q9CXB8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Alpk1Q9CXB8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Alpk1Q9CXB8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Alpk1Q9CXB8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Alpk1Q9CXB8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Alpk1Q9CXB8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Alpk1Q9CXB8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Alpk1Q9CXB8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Alpk1Q9CXB8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Alpk1Q9CXB8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Alpk1Q9CXB8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Alpk1Q9CXB8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Alpk1Q9CXB8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Alpk1Q9CXB8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Alpk1Q9CXB8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Alpk1Q9CXB8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Alpk1Q9CXB8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Alpk1Q9CXB8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Alpk1Q9CXB8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Alpk1Q9CXB8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Alpk1Q9CXB8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Alpk1Q9CXB8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Alpk1Q9CXB8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Alpk1Q9CXB8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Alpk1Q9CXB8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Alpk1Q9CXB8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Alpk1Q9CXB8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Alpk1Q9CXB8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Alpk1Q9CXB8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Alpk1Q9CXB8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Alpk1Q9CXB8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Alpk1Q9CXB8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Alpk1Q9CXB8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Alpk1Q9CXB8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Alpk1Q9CXB8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Alpk1Q9CXB8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Alpk1Q9CXB8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Alpk1Q9CXB8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Alpk1Q9CXB8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Alpk1Q9CXB8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Alpk1Q9CXB8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Alpk1Q9CXB8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Alpk1Q9CXB8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Alpk1Q9CXB8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Alpk1Q9CXB8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms