Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Utp23Q9CX11 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Utp23Q9CX11 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Utp23Q9CX11 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Utp23Q9CX11 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Utp23Q9CX11 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Utp23Q9CX11 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Utp23Q9CX11 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Utp23Q9CX11 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Utp23Q9CX11 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Utp23Q9CX11 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Utp23Q9CX11 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Utp23Q9CX11 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Utp23Q9CX11 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Utp23Q9CX11 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Utp23Q9CX11 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Utp23Q9CX11 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Utp23Q9CX11 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Utp23Q9CX11 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Utp23Q9CX11 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Utp23Q9CX11 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Utp23Q9CX11 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Utp23Q9CX11 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Utp23Q9CX11 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Utp23Q9CX11 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Utp23Q9CX11 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Utp23Q9CX11 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Utp23Q9CX11 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Utp23Q9CX11 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Utp23Q9CX11 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Utp23Q9CX11 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Utp23Q9CX11 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Utp23Q9CX11 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Utp23Q9CX11 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Utp23Q9CX11 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Utp23Q9CX11 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Utp23Q9CX11 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Utp23Q9CX11 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Utp23Q9CX11 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Utp23Q9CX11 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Utp23Q9CX11 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Utp23Q9CX11 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Utp23Q9CX11 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Utp23Q9CX11 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Utp23Q9CX11 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Utp23Q9CX11 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Utp23Q9CX11 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Utp23Q9CX11 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Utp23Q9CX11 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Utp23Q9CX11 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Utp23Q9CX11 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Utp23Q9CX11 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Utp23Q9CX11 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Utp23Q9CX11 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Utp23Q9CX11 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Utp23Q9CX11 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Utp23Q9CX11 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms