Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RpainQ9CWY9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms