Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9CWU4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9CWU4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9CWU4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9CWU4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9CWU4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9CWU4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9CWU4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9CWU4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9CWU4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9CWU4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9CWU4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9CWU4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9CWU4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9CWU4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9CWU4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9CWU4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9CWU4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9CWU4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9CWU4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9CWU4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9CWU4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9CWU4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9CWU4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9CWU4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9CWU4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9CWU4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9CWU4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9CWU4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9CWU4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9CWU4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9CWU4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9CWU4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9CWU4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9CWU4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9CWU4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9CWU4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9CWU4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9CWU4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9CWU4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9CWU4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9CWU4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9CWU4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9CWU4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9CWU4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9CWU4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9CWU4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9CWU4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9CWU4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9CWU4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9CWU4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms