Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWR2

Smyd3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd3Q9CWR2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smyd3Q9CWR2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smyd3Q9CWR2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smyd3Q9CWR2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smyd3Q9CWR2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Smyd3Q9CWR2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Smyd3Q9CWR2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Smyd3Q9CWR2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smyd3Q9CWR2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smyd3Q9CWR2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smyd3Q9CWR2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smyd3Q9CWR2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smyd3Q9CWR2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smyd3Q9CWR2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smyd3Q9CWR2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smyd3Q9CWR2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smyd3Q9CWR2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smyd3Q9CWR2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Smyd3Q9CWR2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smyd3Q9CWR2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smyd3Q9CWR2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Smyd3Q9CWR2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smyd3Q9CWR2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smyd3Q9CWR2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smyd3Q9CWR2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smyd3Q9CWR2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smyd3Q9CWR2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smyd3Q9CWR2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smyd3Q9CWR2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smyd3Q9CWR2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smyd3Q9CWR2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smyd3Q9CWR2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Smyd3Q9CWR2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smyd3Q9CWR2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smyd3Q9CWR2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smyd3Q9CWR2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smyd3Q9CWR2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Smyd3Q9CWR2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smyd3Q9CWR2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smyd3Q9CWR2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smyd3Q9CWR2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smyd3Q9CWR2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smyd3Q9CWR2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Smyd3Q9CWR2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smyd3Q9CWR2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smyd3Q9CWR2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smyd3Q9CWR2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smyd3Q9CWR2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smyd3Q9CWR2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smyd3Q9CWR2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smyd3Q9CWR2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smyd3Q9CWR2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smyd3Q9CWR2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smyd3Q9CWR2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smyd3Q9CWR2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smyd3Q9CWR2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Smyd3Q9CWR2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smyd3Q9CWR2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smyd3Q9CWR2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smyd3Q9CWR2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Smyd3Q9CWR2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smyd3Q9CWR2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smyd3Q9CWR2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smyd3Q9CWR2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smyd3Q9CWR2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms