Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NubplQ9CWD8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms