Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms