Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Klhl28Q9CR40 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms