Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

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Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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Ifitm3Q9CQW9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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Ifitm3Q9CQW9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
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Ifitm3Q9CQW9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
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Ifitm3Q9CQW9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms