Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU3

Rer1, Protein RER1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rer1Q9CQU3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.89■□□□□ 0.14
Rer1Q9CQU3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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